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產(chǎn)品展示
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Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit
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產(chǎn)品型號:
RB4490
產(chǎn)品報價:
9109
產(chǎn)品特點:
Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒,含有靶向基因檢測試劑,該試劑專門針對cfDNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。
  RB4490Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit的詳細資料:

Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq Kit

 

Rubicon Genomics成立于2000年,總部位于美國密歇根州。該公司的核心競爭力產(chǎn)品包括酶學、核酸化學、樣品的加工生產(chǎn),該公司致力于創(chuàng)新、知識產(chǎn)權的發(fā)展和持續(xù)的產(chǎn)品開發(fā)。

 

Rubicon Genomics開發(fā)創(chuàng)新、高品質的、核酸文庫的制備及配套產(chǎn)品,ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit能夠對臨床樣本進行簡單、快速可靠和高靈敏度的分析。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑產(chǎn)品說明:

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒,含有靶向基因檢測試劑,該試劑專門針對cfDNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區(qū)域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit應用于無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測、腫瘤無創(chuàng)檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit可與以雜交為基礎的靶序列富集系統(tǒng)組合使用。

1個反應管、2小時、3步反應的簡單操作(其中手動操作只需要15分鐘),無中間純化步驟,無樣品轉移是必要的,從而防止處理錯誤和有價值樣品的損失。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑應用

  • 胎兒染色體非整倍體檢
  • 無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測
  • 腫瘤無創(chuàng)檢測
  • cfDNA血漿游離DNA檢測

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑訂購信息

品牌     Code No.  Takara No. 包裝量    產(chǎn)品名稱

 

Rubicon R400490     RB4490 12 Rxns  ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

 

歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司        華雅干細胞-:

 

提供產(chǎn)品:華雅干細胞致力于為中國干細胞領域的干細胞科學研究、臍帶血/造血干細胞/臍帶/脂肪/胎盤干細胞庫、干細胞臨床轉化醫(yī)學、干細胞美容及干細胞抗衰老、免疫細胞治療、T細胞治療、臨床干細胞治療等再生醫(yī)學和個體化治療產(chǎn)業(yè)鏈的相關客戶提供:MSC間充質干細胞培養(yǎng)基、iPS/ES胚胎干細胞培養(yǎng)基、血清替代物、羊水培養(yǎng)基、基底膜基質膠細胞支架、干細胞生長分化調控因子、BioMarker 流式檢測抗體、支原體檢測試劑盒、內毒素檢測試劑盒、干細胞存儲細胞凍存袋、細胞培養(yǎng)瓶、USP級DMSO二甲基亞砜細胞凍存液、細胞培養(yǎng)相關試劑耗材儀器等種類豐富的產(chǎn)品,以“Focus on improving the quality of Stem Cells專注干細胞研究,提升干細胞品質”為己任,我們與客戶攜手為中國干細胞產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑產(chǎn)品組成

  • 模板準備緩沖液(紅色)
  • 模板準備酶(紅色)
  • 文庫合成緩沖液(黃色)
  • 文庫合成酶(黃色)
  • 文庫擴增緩沖液(綠色)
  • 文庫擴增酶(綠色)
  • 無核酸酶水
  • 索引試劑(藍色)
  • 使用方法

 

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑原理

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit基于Rubicon Genomics的ThruPLEX技術含有靶向基因檢測試劑。與其它基于Y型適配器連接的NGS圖書館準備工具不同,ThruPLEX使用莖環(huán)適配器在快速高效的工作流程中構建高質量的庫。在*步,模板制備時,修復無細胞DNA(cfDNA)并產(chǎn)生具有鈍端的分子。在下一步中,具有封閉的5'端的銜接子以高效率連接到cfDNA的5'末端,留下切口目標片段的3'末端。適配器不具有單鏈突出端并被阻止相互結合,這兩者都有助于與許多其他NGS發(fā)現(xiàn)的非特異性背景準備工作。在zui后一步中,擴增cfDNA的3'末端以完成文庫合成和光合作用索引通過高保真放大增加。任何剩余的免費適配器被銷毀。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit通過使用單管協(xié)議并消除實際操作時間和污染風險zui小化。

Rubicon血漿游離DNA檢測試劑盒ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit屬于胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒,含有靶向基因檢測試劑,適用于無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測、腫瘤無創(chuàng)檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測。

 

RB4490 血漿游離DNA檢測試劑工作流程:

  • 模板準備有效修復輸入的無細胞DNA;
  • 用于連接Rubicon Genomics的莖環(huán)適配器的文庫合成;
  • 用于擴展模板的庫擴增,莖環(huán)接頭的切割以及放大文庫,還使用高保真度引入與Illumina兼容的索引,低偏差DNA聚合酶。  

 

 

圖1. ThruPLEX® 技術概要。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

ThruPLEX Plasma-seq Kit技術3步反應即可完成針對cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進行末端修復。通過采用莖環(huán)形接頭(無單鏈尾巴)進行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進一步降低背景。高保真度擴增的方式完成以上反應,并獲得含有illumina index的文庫。

 

 

圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

圖中針對0.1ng、1ng、30ng的cell-free DNA,使用ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit、A公司試劑盒和C公司試劑盒制備文庫,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,每個樣品得到約17-25 M read(PE)。每個文庫在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后,計算Duplication rates。重復read比例以每個樣品17M計算。

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit與其他公司試劑盒相比,針對不同input量,使用本試劑盒制備的文庫相比其他公司試劑盒制備的文庫,本試劑盒制備的文庫的多樣性(左圖)是zui高的,重復read的比例(中間圖)、unmapped read的比例(右圖)較其他公司低。通過使用本試劑盒,input量很低時也可制備得到高品質的文庫。在無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測、腫瘤無創(chuàng)檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測等領域ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit優(yōu)于其他產(chǎn)品,深受胎兒染色體非整倍體檢測和腫瘤學科研工作者的重視。

 

歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司        華雅干細胞-:

 

提供產(chǎn)品:華雅干細胞致力于為中國干細胞領域的干細胞科學研究、臍帶血/造血干細胞/臍帶/脂肪/胎盤干細胞庫、干細胞臨床轉化醫(yī)學、干細胞美容及干細胞抗衰老、免疫細胞治療、T細胞治療、臨床干細胞治療等再生醫(yī)學和個體化治療產(chǎn)業(yè)鏈的相關客戶提供:MSC間充質干細胞培養(yǎng)基、iPS/ES胚胎干細胞培養(yǎng)基、血清替代物、羊水培養(yǎng)基、基底膜基質膠細胞支架、干細胞生長分化調控因子、BioMarker 流式檢測抗體、支原體檢測試劑盒、內毒素檢測試劑盒、干細胞存儲細胞凍存袋、細胞培養(yǎng)瓶、USP級DMSO二甲基亞砜細胞凍存液、細胞培養(yǎng)相關試劑耗材儀器等種類豐富的產(chǎn)品,以“Focus on improving the quality of Stem Cells專注干細胞研究,提升干細胞品質”為己任,我們與客戶攜手為中國干細胞產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

 

 

圖3. 優(yōu)異的靶向測序文庫構建能力。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫通過panel進行高效捕獲,對kinome進行深度測序分析以檢測突變。分別以5 ng、6.5 ng、10 ng 3個血漿樣品為起始建庫量,三次重復。目標區(qū)域經(jīng)SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進行捕獲,并用Illumina Miseq平臺進行測序,每個文庫獲得5 M reads,目標堿基被成功捕獲分析。在30x覆蓋度時,平均77%的堿基被覆蓋。 

 

圖4. 高重復性的、無偏倚的GC覆蓋度。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

針對人類基因組,ThruPLEX Plasma-seq Kit表現(xiàn)出高再現(xiàn)性、低偏倚GC覆蓋度NGS文庫構建能力。9次獨立的血漿樣品文庫構建的實驗結果表明,ThruPLEX重復性高于其它產(chǎn)品。文庫的制備是利用的1 mL血漿來源cfDNA,后續(xù)采用illumina NextSeq 500進行測序。作為對比,NEBNext Ultra構建了4份獨立血漿樣品的文庫。

 

圖5. Karolinska協(xié)會和CRUK測試的結果。

(*以上數(shù)據(jù)來源于Karolinska 協(xié)會,瑞典)

5 ng游離cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit進行illumina文庫構建。結果表明利用Hiseq平臺進行的Low-pass WGS,每個文庫能獲得接近12.5 M reads。無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測、腫瘤無創(chuàng)檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測科研工作者的重視。 

 

ThruPLEX® Plasma-seq Kit 胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒

  • 專為cfDNA設計:經(jīng)過優(yōu)化的修復及連接試劑
  • 高品質NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內,可以達到高檢測再現(xiàn)性
  • 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量
  • 快速簡便:無需純化或樣品轉移的單管、2小時、3步操作步驟
  • 應用領域:液態(tài)活檢、ctDNA、目標區(qū)域測序等領域文庫構建
  • 兼容自動化平臺:Beckman® FXP Workstation
  • Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測、腫瘤無創(chuàng)檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。

 

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提供產(chǎn)品:華雅干細胞致力于為中國干細胞領域的干細胞科學研究、臍帶血/造血干細胞/臍帶/脂肪/胎盤干細胞庫、干細胞臨床轉化醫(yī)學、干細胞美容及干細胞抗衰老、免疫細胞治療、T細胞治療、臨床干細胞治療等再生醫(yī)學和個體化治療產(chǎn)業(yè)鏈的相關客戶提供:MSC間充質干細胞培養(yǎng)基、iPS/ES胚胎干細胞培養(yǎng)基、血清替代物、羊水培養(yǎng)基、基底膜基質膠細胞支架、干細胞生長分化調控因子、BioMarker 流式檢測抗體、支原體檢測試劑盒、內毒素檢測試劑盒、干細胞存儲細胞凍存袋、細胞培養(yǎng)瓶、USP級DMSO二甲基亞砜細胞凍存液、細胞培養(yǎng)相關試劑耗材儀器等種類豐富的產(chǎn)品,以“Focus on improving the quality of Stem Cells專注干細胞研究,提升干細胞品質”為己任,我們與客戶攜手為中國干細胞產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

產(chǎn)品相關關鍵字: 胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒 無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測 腫瘤無創(chuàng)檢測 cfDNA血漿游離DNA檢測 靶向基因檢測試劑
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